
Православный олигарх, имеющий дружеские отношения с кремлевским чиновником Игорем Щеголевым, бывшим руководителем администрации президента Сергеем Ивановым, патриархом Кириллом и другими высокопоставленными лицами. По одной из версий, Малофеев мог сотрудничать с органами безопасности.
Стал известен широкой публике в начале 10-х годов как фигурант уголовного дела, связанного с хищением средств у государственного банка ВТБ
. Суд в Лондоне, рассматривавший это дело, в 2011 году даже арестовал активы, связанные с Малофеевым, а МВД проводило обыски в его доме. В конечном счете расследование окончилось для Малофеева безболезненно — он как и прежде оказывает важные услуги российскому руководству, в том числе спонсируя войну в Украине и насаждая цензуру.
В 2011 году Малофеев создал так называемую «Лигу безопасного интернета» — организацию, призванную цензурировать рунет. Быть председателем попечительского совета он пригласил своего друга, высокопоставленного сотрудника Администрации президента Игоря Щеголева. С 2017 года лигой руководит член Общественной палаты и профессиональная доносчица Екатерина Мизулина. Это дочь депутата, а ныне сенатора Елены Мизулиной, которая прославилась как автор ряда законов о цензуре интернета.
Считается одним из спонсоров так называемой «русской весны» — в 2014 году финансировал конфликт на Донбассе, в том числе через движение «Антимайдан» и своего начальника службы безопасности Игоря Гиркина, более известного как Стрелков. Позже через подконтрольные ему СМИ, включая ультраправый телеканал «Царьград», разжигал войну с помощью антиукраинской пропаганды.
Малофеев учредил два благотворительных фонда, завязанных на политику: «Святителя Василия Великого», гендиректором которого является жена министра чрезвычайных ситуаций Александра Куренкова, а также фонд «Царьград», цель которого — «формировать образ будущего России».
В 2024 году православный олигарх бросил прежнюю супругу, с которой у него трое детей, чтобы жениться на Марии Львовой-Беловой, которая до этого тоже находилась в браке — была замужем за священником РПЦ, с которым воспитывала 10 детей, в том числе пять приемных.